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Scoperto un virus che potrebbe essere la chiave per curare il diabete tipo 2

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Come un gruppo di ricercatori della San Diego State University ha appena reso pubblico su Nature Communications, metà di noi ospita il virus crAssphage nel nostro intestino, dal nome del programma per computer che lo ha trovato. 

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Questo microrganismo, che ha 10 volte più coppie di basi di DNA rispetto al virus dell’AIDS, infetta un gruppo molto ampio di batteri intestinali: i Bacteroidetes, che sembrano svolgere un ruolo importante nei meccanismi dell’obesità umana. 

La rivista Very Interesting dice che gli scienziati sperano che la scoperta del crAssphage aiuterà non solo a combattere il sovrappeso morboso, ma servirà anche a prevenire o curare altri disturbi associati all’apparato digerente come il diabete.

Il fatto che il DNA del virus del batteriofago sia stato rilevato in campioni fecali di circa il 50% degli individui suggerisce che sia vecchio almeno quanto l’Homo sapiens stesso. 

È stato anche riscontrato che non compare nei neonati, quindi è probabilmente acquisito durante l’infanzia. 

Informazioni estese

CrAssphage, che infetta uno dei tipi più comuni di batteri intestinali, Bacteroidetes. Si ritiene che questo phylum di batteri sia collegato all’obesità, al diabete e ad altre malattie legate all’intestino.

Robert A. Edwards, professore di bioinformatica all’SDSU, e i suoi colleghi si sono imbattuti nella scoperta per caso. Lavorando con il ricercatore in visita e studiando l’autore corrispondente Bas E. Dutilh, ora al Radboud University Medical Center nei Paesi Bassi, i ricercatori hanno utilizzato i risultati di studi precedenti sui virus che risiedono nell’intestino per individuare nuovi virus. 

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Nei campioni di DNA fecale di 12 individui diversi, hanno notato un particolare gruppo di DNA virale comune nei campioni, lungo circa 97.000 paia di basi. Quando Edwards e i suoi colleghi hanno verificato se fosse presente in un elenco completo di virus noti, non hanno trovato nulla.

I ricercatori hanno quindi esaminato il database del National Institute of Health (NIH) Human Microbial Project (HMP) e il database MG-RAST dell’Argonne National Laboratory, e hanno nuovamente trovato il DNA in abbondanza nei campioni derivati ??dalle feci. 

Per dimostrare che il DNA virale che hanno scoperto nei dati del loro computer esiste effettivamente in natura, il virologo della SDSU John Mokili ha utilizzato una tecnica nota come amplificazione del DNA per individuare il virus nei campioni originali utilizzati per costruire il database del NIH. 

Si trattava di un nuovo virus presente in circa la metà dei campioni delle persone incluse, e che fino ad allora nessuno sapeva.

“Non è insolito cercare un nuovo virus e trovarlo”, ha detto Edwards. “Ma è molto raro trovarne uno che molte persone abbiano in comune. Il fatto che abbia volato sotto il radar per così tanto tempo è molto strano”. 

Un virus antico

Il fatto che sia così diffuso indica che probabilmente non è un virus particolarmente giovane. 
“In pratica l’abbiamo trovato in ogni popolazione che abbiamo visto”, ha detto Edwards. “Quindi possiamo dire che è vecchio quanto l’essere umano.” 

Edwards e il suo team l’hanno chiamato crAssphage, dal nome del programma per computer utilizzato per scoprirlo.
Alcune delle proteine ??nel DNA di crAssphage sono simili a quelle che si trovano in altri virus ben descritti. Ciò ha permesso al team di Edwards di determinare che il nuovo virus è del tipo noto come batteriofago, che infetta e si replica all’interno dei batteri. 

Utilizzando tecniche bioinformatiche innovative, hanno previsto che questo particolare batteriofago prolifera infettando un phylum comune di batteri intestinali noto come Bacteriodetes. 

I batteri Bacteriodetes vivono vicino alla fine del tratto intestinale e si sospetta che svolgano un ruolo nel legame tra i batteri intestinali e l’obesità. Il ruolo svolto da crAssphage in questo processo sarà oggetto di ricerche future.

Una volta isolato, il virus dovrebbe approfondire il suo ruolo nell’obesità. È possibile che il virus media in qualche modo l’attività delle colonie di Bacteriodetes, ma resta da vedere se il crAssphage promuova o sopprima i processi legati all’obesità nell’intestino. 

Il virus può essere utilizzato anche per prevenire o mitigare altre malattie colpite dall’intestino, come il diabete e le malattie gastrointestinali.

Articolo scientifico: Bas E. Dutilh, Noriko Cassman, Katelyn McNair, Savannah E. Sanchez, Genivaldo GZ Silva, Lance Boling, Jeremy J. Barr, Daan R. Speth, Victor Seguritan, Ramy K. Aziz, Ben Felts, Elizabeth A. Dinsdale, John L. Mokili, Robert A. Edwards. Un batteriofago molto abbondante scoperto nelle sequenze sconosciute dei metagenomi fecali umani. Nature Communications 5, Numero articolo: 4498, doi: 10.1038/ncomms5498
Fonte: Università di San Diego

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