La banca dell’immagine del pancreas aiuterà a far avanzare la ricerca sul diabete in tutto il mondo
La più ampia banca di immagini di campioni del pancreas di bambini che hanno sviluppato il diabete poco prima della morte è stata pubblicata presso il Vanderbilt University Medical Center, con l’obiettivo di far avanzare la ricerca medica globale nel campo del diabete.
L’Università di Exeter e il Vanderbilt University Medical Center (VUMC) hanno collaborato per rendere disponibili immagini ad alta risoluzione del tessuto pancreatico in Pancreatlas, il primo database di imaging in linea al mondo del tessuto pancreatico umano creato e ospitato presso il VUMC.
Il pancreas contiene le cellule beta che producono l’insulina che controlla la glicemia e per questo è implicata in malattie come il diabete. La banca di immagini è una risorsa preziosa per i ricercatori perché il pancreas umano non può essere sottoposto a biopsia in sicurezza e lo studio dei cambiamenti cellulari che causano il diabete di tipo 1 può essere intrapreso solo in campioni di pancreas di individui con la malattia dopo la loro morte.
L’Exeter Archivival Diabetes Biobank (EADB) include 345 immagini di tessuto post mortem procurato dall’ex professore dell’Università di Glasgow Alan Foulis negli anni ’80. Queste immagini rappresentano la più grande raccolta di campioni di pancreas recuperati da pazienti deceduti poco dopo la diagnosi di diabete di tipo 1.
Foulis ha lasciato in eredità la collezione di tessuti alla University of Exeter Medical School al momento del suo ritiro, e i campioni sono stati quindi digitalizzati dal professor Peter In’t Veld della Vrije Universiteit Brussel. I curatori della collezione, i professori di Exeter Noel Morgan, Ph.D., e Sarah Richardson, Ph.D., hanno contattato i creatori di Pancreatlas per vedere se le immagini potevano essere aggiunte al database online e rese disponibili a chiunque nel mondo. I professori di Exeter hanno poi facilitato il trasferimento delle immagini.
“Siamo entusiasti che questo prezioso archivio sia ora accessibile agli investigatori di tutto il mondo tramite la piattaforma Pancreatlas”, ha affermato Diane Saunders, Ph.D., ricercatrice assistente professore di medicina e co-direttore scientifico di Pancreatlas.
“Non solo questo è un gruppo unico di campioni, ma l’Exeter Archivival Diabetes Biobank ha consentito progressi fondamentali nella ricerca sul pancreas umano, incluso il profilo dell’insulite e l’evidenza del coinvolgimento virale nella guida dell’autoimmunità delle cellule beta a livello di isole. È il nostro aspettativa che queste immagini continueranno a stimolare le scoperte scientifiche mentre i ricercatori lavorano per demistificare lo sviluppo del diabete di tipo 1”.
Le 345 immagini dell’EADB rappresentano 189 diversi donatori di età compresa tra tre mesi e 17 anni. L’insorgenza del diabete di tipo 1 varia da pochi giorni dalla morte a 19 anni di durata. Le immagini sono di sezioni di tessuto colorate utilizzando ematossilina ed eosina (H&E) o mediante immunoistochimica mirando ai biomarcatori proteici agli ormoni e ad altre proteine ??di segnalazione.
“Per fortuna, la maggior parte delle persone muore molto tempo dopo la diagnosi di diabete di tipo 1, ma questo significa che la disponibilità di organi in cui il processo patologico è ancora attivo è molto rara”, ha affermato Morgan, professore di farmacologia endocrina all’Università. di Exeter.
“Di conseguenza, pochissime persone in tutto il mondo che stanno studiando il diabete di tipo 1 sono state in grado di studiare i tessuti di bambini piccoli con diabete di tipo 1 di recente insorgenza.
“La fornitura di questi record EADB unici tramite Pancreatlas è uno sviluppo importante perché fornisce un facile accesso a un pubblico globale e pone questa raccolta nel contesto di altre raccolte di immagini del pancreas estremamente importanti disponibili sul sito. I criteri di ricerca e i sistemi di annotazione sviluppati da il team di Vanderbilt consente ai ricercatori di selezionare le immagini più rilevanti per i propri studi e di visualizzarle ad alta risoluzione dalle proprie scrivanie”.
In totale, Pancreatlas ospita attualmente 2.180 immagini, che rappresentano diverse biobanche e iniziative di ricerca. Il sito fornisce alla comunità scientifica l’accesso alle immagini annotate del tessuto del pancreas umano e alle caratteristiche associate del donatore con la speranza di far progredire la comprensione di malattie come il diabete, il cancro del pancreas e la pancreatite.
Il database online delle immagini è stato progettato secondo i principi dell’automazione e della scalabilità, nonché della facilità d’uso. Le immagini sono raggruppate in raccolte curate per una facile esplorazione di argomenti specifici o stati patologici o, in alternativa, gli utenti possono cercare immagini di interesse in tutte le raccolte. I menu di filtraggio consentono agli utenti di visualizzare e perfezionare le immagini sulla base di informazioni sperimentali (ad es. elaborazione dei tessuti, biomarcatori visualizzati) e dettagli clinici (ad es. stato della malattia e durata).
Pancreatlas include anche set di dati di immagini completi di tutta la durata della vita umana per fornire un contesto ai ricercatori che lavorano, ad esempio, per capire come lo sviluppo del pancreas può essere correlato alla progressione del diabete o alle origini del cancro del pancreas.
La ricerca è stata pubblicata su Patterns .
Ulteriori informazioni: Diane C. Saunders et al, Pancreatlas: Applying an Adaptable Framework to Map the Human Pancreas in Health and Disease, Patterns (2020). DOI: 10.1016/j.patter.2020.100120
Pancreatlas: www.pancreatlas.org/